Strukturę organizacyjną Urzędu tworzą:

Kierownictwo Urzędu:

1. Burmistrz Miasta Kalwarii Zebrzydowskiej
2. Zastępca Burmistrza Miasta Kalwarii Zebrzydowskiej
3. Skarbnik Gminy Kalwaria Zebrzydowska
4. Sekretarz Gminy Kalwaria Zebrzydowska

Komórki organizacyjne i samodzielne stanowiska pracy:

1. Referat Budżetowy (RB)
2. Referat Finansowy (RF)
3. Referat Ewidencji Ludności i Dowodów Osobistych (EDO)
4. Referat Rolnictwa i Nieruchomości (RN)
5. Referat Działalności Gospodarczej i Promocji (PDG)
6. Referat Inwestycji i Drogownictwa (IDR)
7. Referat Gospodarki Komunalnej (GK)
8. Zespół Pozyskiwania Środków Zewnętrznych (ZPŚ)
9. Stanowisko Zarządzania Kryzysowego, Spraw Obronnych i OC (ZKOC)
10. Pełnomocnik Ochrony Informacji Niejawnych (POIN)
11. Urząd Stanu Cywilnego (USC)
12. Sekretariat (SA)
13. Stanowiska ds. Architektury
14. Stanowisko ds. Zdrowia, Oświaty, Kultury i Sportu
15. Stanowisko ds. Zamówień Publicznych
16. Biuro Obsługi Mieszkańców (BOM)
17. Biuro Rady (BR)
18. Kadry (KD)
19. Informatyk (IN)

Schemat organizacyjny Urzędu Miasta Kalwarii Zebrzydowskiej