Początki działalności Szpitala datuje się na 1948 rok, kiedy to powstało Pogotowie Chirurgiczno - Położnicze, a z czasem uzyskało nazwę Szpitala Powiatowego.

Z upływem czasu powiększał się zakres działalności Szpitala,  w wyniku czego pomieszczenia zajmowane przez Szpital  okazały się zbyt małe i w roku 1972 zostały wybudowane obecnie istniejące budynki. Od od 1 stycznia 1973 r. rozpoczęto działalność leczniczą w tych pomieszczeniach, jako Zespół  Opieki Zdrowotnej.

30 lipca 1989 r. został przekształcony w Samodzielny Publiczny Zakład Opieki Zdrowotnej. Dnia 26 kwietnia 2000 r. został zatwierdzony jako Szpital Powiatowy w Limanowej.

        Szpital Powiatowy w Limanowej zarejestrowany jest  w Krajowym Rejestrze Sądowym pod numerem
KRS 0000019390 dokonanym w Sądzie Rejonowym dla Krakowa Śródmieścia  Wydział XII Gospodarczy oraz wpisany do rejestru zakładów opieki zdrowotnej Wojewody Małopolskiego pod numerem 000000006061.