Regionalny Zarząd Gospodarki Wodnej w Krakowie usytuowany jest w południowo-wschodniej Polsce i obejmuje prawie w całości dorzecze Górnej Wisły (począwszy od ujścia Przemszy do ujścia Sanny) oraz niewielkie części zlewni Strwiąża (dorzecze Dniestru)i Czarnej Orawy (dorzecze Dunaju) należących do zlewiska Morza Czarnego.
Powierzchnia obszaru działania RZGW w Krakowie wynosi 43 703 km².

Obszar działania Regionalnego Zarządu Gospodarki Wodnej w Krakowie zajmuje 14 % obszaru Polski, obejmując:

• 5 województw, tj.:
  • woj. podkarpackie w 99,5 %,
  • woj. małopolskie w 95 %,
  • woj. świętokrzyskie w 64,5 %,
  • woj. lubelskie w 11 %,
  • woj. śląskie w 10 %;
• 63 powiaty;
• 456 gmin, z tego 41 gmin podzielonych granicą wododziału (granicą RZGW);
• około 120 miast, z tego 10 miast liczących więcej niż 50 tys. mieszkańców.