Opera Krakowska działa na podstawie wpisu w Księdze Rejestrowej Nr RIK 2/99 założonej w dniu 12 lipca 1999 oraz Statutu stanowiącego załącznik nr 1 do uchwały nr 161/02 Zarządu Województwa Małopolskiego.

Jedynym obiektem stanowiącym własność Opery jest budynek przy ul. Lubicz 48, który został zaadaptowany dla potrzeb Opery w roku 1954.

W 2002 r. Zarząd Województwa Małopolskiego podjął pierwsze decyzje w sprawie realizacji inwestycji mającej na celu przebudowę i modernizację obiektu Opery przy ul. Lubicz 48. W 2003 r. przeprowadzono prace rozbiórkowe części obiektów, przygotowując tym samym teren pod przyszłą budowę. W połowie września 2004 roku został przekazany plac budowy. Nowy budynek Opery, realizowany wg projektu krakowskiego architekta Romualda Loeglera, ma być ukończony w grudniu 2008 roku.

Budowa jest współfinansowana przez budżet Województwa Małopolskiego, Ministerstwo Kultury w ramach programu Promesa Ministra Kultury oraz Unię Europejską w ramach Programu ZPORR.