Zarząd województwa jest organem wykonawczym.
W jego skład wchodzi 5 osób: marszałek, dwóch wicemarszałków i dwaj członkowie zarządu.

Zarząd Województwa jest wybierany przez Sejmik Województwa. Zarząd wykonuje zadania należące do samorządu województwa, niezastrzeżone na rzecz sejmiku województwa i wojewódzkich samorządowych jednostek organizacyjnych, a w szczególności wykonuje uchwały sejmiku województwa, gospodaruje mieniem województwa.

Podczas sesji w dniu 31.05.2004 Sejmik Województwa Małopolskiego przyjął "Uchwałą nr XX/292/04 w sprawie przyjęcia rezygnacji i zwolnienia z pełnienia obowiązków czlonka Zarządu Województwa Małopolskiego"  rezygnację wicemarszałka Krzysztofa Deszyńskiego z zajmowanego stanowiska.

Podczas sesji w dniu 28.06.2004 Sejmik Województwa Małopolskiego przyjął uchwałę w sprawie wyboru Wicemarszałka Województwa Małopolskiego - Witolda Śmiałka.

W dniu 24 kwietnia 2006 Wicemarszałek Województwa Małopolskiego Witold Śmiałek złożył rezygnację z pełnienia obowiązków członka Zarządu Województwa Małopolskiego (31 maja 2006 upłynął termin określony w art 40 ust. 2 ustawy o samorządzie województwa).

Podczas sesji w dniu 1.06.2006 Sejmik Województwa Małopolskiego przyjął uchwałę w sprawie wyboru Wicemarszałka Województwa Małopolskiego - Zbysława Owczarskiego