Małopolski Urząd Wojewódzki w Krakowie zapewnia wykonanie przez Wojewodę Małopolskiego zadań wynikających ze sprawowania przez Wojewodę Małopolskiego funkcji:
1) przedstawiciela Rady Ministrów w województwie,
2) zwierzchnika zespolonej administracji rządowej,
3) organu nadzoru nad jednostkami samorządu terytorialnego,
4) organu wyższego stopnia w rozumieniu przepisów o postepowaniu administracyjnym,
5) reprezentanta Skarbu Państwa, w zakresie i na zasadach określonych w odrębnych ustawach.

Małopolski Urząd Wojewódzki w Krakowie realizuje ponadto inne zadania nałożone na Wojewodę Małopolskiego przepisami ustaw szczególnych i aktów wydanych w celu ich wykonania.